2020年度企业所得税汇算清缴正在进行，其中的一项重要工作，就是梳理、核实研发费用加计扣除基数，以准确计算企业所得税应纳税所得额。

但是，税务人员在风险应对过程中发现，享受研发费用加计扣除优惠过程中，存在税务风险的企业并不少。建议相关企业，享受研发费用加计扣除优惠，不能盲目增加加计扣除基数。

风险一：管理层工资计入人工费用

案例：甲科技企业在归集研发费用时，将企业的董事长、总经理以及财务负责人归集于研发人员名单中，这些人员的工资、薪金也相应计入研发费用中的人员人工费用，享受加计扣除税收优惠。另外，甲公司的研发人员占公司总人数的50%以上，占比较高，可能存在研发人员既从事研发活动又从事日常生产活动，但未合理划分的税务风险。

根据《国家税务总局关于研发费用税前加计扣除归集范围有关问题的公告》（国家税务总局公告2017年第40号，以下简称“40号公告”）规定，人员人工费用，指直接从事研发活动人员的工资薪金、基本养老保险费、基本医疗保险费、失业保险费、工伤保险费、生育保险费和住房公积金，以及外聘研发人员的劳务费用。其中，直接从事研发活动人员，包括研究人员、技术人员、辅助人员。研究人员指主要从事研究开发项目的专业人员；技术人员指具有工程技术、自然科学和生命科学中一个或一个以上领域的技术知识和经验，在研究人员指导下参与研发工作的人员；辅助人员指参与研究开发活动的技工。外聘研发人员指与本企业或劳务派遣企业签订劳务用工协议（合同）和临时聘用的研究人员、技术人员、辅助人员。　　

从董事长、总经理、财务负责人的岗位性质来看，这些人员均属于企业管理人员，负责企业日常全面工作，与研发活动关联度不高，其工资、薪金不应计入研发费用中的人员人工费用。根据40号公告的规定，直接从事研发活动的人员或外聘研发人员，同时从事非研发活动的，企业应对其人员活动情况做必要记录，并将其实际发生的相关费用，按实际工时占比等合理方法在研发费用和生产经营费用间分配，未分配的，不得享受加计扣除优惠。因此，甲公司研发费用中列支的董事长、总经理、财务负责人以及未按合理方法合理分配的人员工资、薪金不得享受加计扣除，企业应调增企业所得税应纳税所得额，补缴企业所得税，并缴纳相应的滞纳金。

风险二：研发过程中的特殊收入未扣减

案例：税务人员在对乙化工企业开展研发费用加计扣除风险核查时发现，乙公司每年研发活动直接消耗材料费用发生额达3000万元以上，占年度研发费用发生额的90%，占其年度原材料采购总额的30%以上。同时，当年应扣除的销售研发活动形成产品对应材料部分，以及特殊收入均为0。

税务人员分析，化工企业投入的原材料均为化工产品，部分原材料含有毒有害物质，如果领用的3000万元材料未形成产成品，很可能就是废品。化工产品的废品处理有着严格的处理流程，处理费用也是很大一笔开销，乙公司研发费用使用不符合常理，存在较大税务风险。

根据40号公告的规定，企业研发活动直接形成产品或作为组成部分形成的产品对外销售的，研发费用中对应的材料费用不得加计扣除。企业取得研发过程中形成的下脚料、残次品、中间试制品等特殊收入，在计算确认收入当年的加计扣除研发费用时，应从已归集研发费用中扣减该特殊收入，不足扣减的，加计扣除研发费用按零计算。

据此，税务人员与企业财务人员沟通核实。经了解，乙公司领用的3000万元材料有一部分形成了产品或残次品并已售出，应当将研发过程中形成产成品所对应的材料费用，和销售产品或残次品所形成的特殊收入，从加计扣除基数中减除。最终，乙公司应调增应纳税所得额，补缴企业所得税，并缴纳相应的滞纳金。

风险三：委托境外研发费用未登记

案例：丙公司是一家主营汽车零部件制造的企业。2020年，丙公司发生研发费用1000万元，其中400万元为委托境外机构进行研发活动发生的费用。但税务机关在帮助丙公司梳理2020年度研发费用加计扣除归集情况时发现，该企业委托境外研究开发的合同，并未到科技行政主管部门进行登记，却依旧将该部分费用纳入研发费用加计扣除基数内。

针对委托境外研究开发费用，《财政部 税务总局 科技部关于企业委托境外研究开发费用税前加计扣除有关政策问题的通知》（财税〔2018〕64号）第二条规定，委托境外进行研发活动应签订技术开发合同，并由委托方到科技行政主管部门进行登记。相关事项按技术合同认定登记管理办法及技术合同认定规则执行。企业应在年度申报享受优惠时，将相关资料留存备查。留存备查资料中应包括经科技行政主管部门登记的委托境外研发合同。

据此，经科技行政主管部门登记的委托研发合同是丙公司享受研发费用加计扣除的要件。考虑到丙公司委托境外研究开发合同并未到科技行政主管部门进行登记，该委托研发费用不能作为其加计扣除的依据，丙公司需要调增当年企业所得税应纳税所得额。不过，如果委托研发合同符合科技管理部门的登记要件，丙公司可前往科技管理部门补登记，完成登记备案后，即可立刻享受研发费用加计扣除优惠。

来源：中国税务报